Идентификация распределения гидрофобных областей и пространственного заряда в первичной структуре полипептидов методами фрактального анализа
- 1 аспирант, кафедра сопротивления материалов и основ теории упругости, ФГОУ ВПО «Казанский государственный архитектурно-строительный университет»
- 2 к.б.н., ст. преподаватель, кафедра водоснабжения и водоотведения, ФГОУ ВПО «Казанский государственный архитектурно-строительный университет»
- 3 аспирант, кафедра радиотехнических систем, СПбГЭТУ «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина)
- 4 к.т.н., докторант, кафедра радиотехнических систем, СПбГЭТУ «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина)
Аннотация
Исследованы свойства распределения аминокислотных остатков в белках различных функциональных групп у патогенных грамположительных и грамотрицательных микроорганизмов применительно к гидрофобности, полярности и пространственному заряду. Установлено, что мембраносвязанные белки грамположительных микроорганизмов характеризуются более выраженной кластеризацией аминокислотных остатков с одинаковыми свойствами, в особенности по гидрофобности, а мультифрактальные свойства отмечаются только при анализе распределения пространственного заряда.

Для цитирования
Мухаметшин А.Т., Каюмов А.Р., Маркелов О.А., Богачев М.И. Идентификация распределения гидрофобных областей и пространственного заряда в первичной структуре полипептидов методами фрактального анализа // Биомедицинская радиоэлектроника. 2012. № 1. С. 41–44.
Список источников
- Betts M.J., Russell R.B. Amino acid properties and consequences of subsitutions // In Bioinformatics for Geneticists, / eds. M.R. Barnes, I.C. Gray. Wiley. 2003.
- Bruce A., Johnson A., Lewis J., Raff M., Roberts K., Walters P. The Shape and Structure of Proteins. Molecular Biology of the Cell; Fourth Edition. New York and London: Garland Science. 2002.
- Kayumov A., Heinrich A., Fedorova K., Iljinskaya O., Forchhammer K. Interaction of the general transcription factor TnrA with the PII-like protein GlnK and glutamine synthetase in Bacillus subtilis // FEBS Journal. 2011. V. 278. P. 1779 - 1789.
- KantelhardtJ. W. etal.PhysicaA. 2002. V. 316. P. 87 - 114.
- Каюмов А.Р., Богачев М.И. Исследование статистических свойств первичной структуры факторов патогенности белковой природы // Биомедицинская радиоэлектроника. 2011. № 5. С. 24 - 27.
- Bogachev M.I., Eichner J.F., Bunde A. The effects of multifractality on the statistics of return intervals // Eur. Phys. J. 2008. Spec. Topics 161. P. 181 - 193.
- Богачев М.И.К вопросу об использовании долговременной зависимости при прогнозировании выбросов в системах метеорологического и гидрологического мониторинга // Известия вузов России. Сер. Радиоэлектроника. 2010. № 4. С. 45 - 53.
- Богачев М.И., Каюмов А.Р. Сравнительный анализ первичной структуры белков патогенных и непатогенных микроорганизмов при помощи математического аппарата интервальных статистик // Биомедицинская радиоэлектроника. 2010.№ 11. C. 4 - 9.