Е.И. Антонова1, Н.В. Фирсова2, А.Б. Ачилов3, А.Р. Зимнуров4, Е.В. Балацюк5

1–5 Научно-исследовательский центр фундаментальных и прикладных проблем биоэкологии и биотехнологии ФГБОУ ВО Ульяновский государственный педагогический университет им. И.Н. Ульянова (г. Ульяновск, Россия)

1 antonov_67@mail.ru, 2 n-firsova@mail.ru, 3 a.achilow@inbox.ru, 4 zimnurov75@gmail.com, 5 balacyxa@mail.ru

Постановка проблемы. Узловая меланома занимает 2-е место по распространенности, характеризуется быстрым вертикальным ростом, затрудняя раннюю диагностику. Амеланотический вариант имитирует различные формы опухолей, с непропорционально высокой смертностью, связанной с поздней диагностикой, что объясняет 89 % ошибок при диагностике. Интеграция высокочувствительных диагностических тестов в клинические исследования становится незаменимой, когда гистологические исследования не позволяют поставить окончательный диагноз. Мультиплексные методы детекции мутаций с использованием технологии xMAP позволяют получить результат в короткие сроки, одновременно анализируя несколько параллельных реакций различных мишеней.

Цель работы – отработка мультиплексного отечественного протокола xMAP-ASPE-xTAG с одномоментным в одном аналите определением мутаций генов (BRAF, MITF, CDKN2A) на примере узлового подтипа меланомы и ее вариантов – пигментная и амеланотическая, для ранней диагностики наиболее агрессивного подтипа меланомы, развитие которого занимает от нескольких недель до нескольких месяцев.

Результаты. Выявлено, что wtBRAF NM, в большей мере чем mtBRAF NM и ANM, проявляют наследственный характер развития; это подтверждается выявленными мутациями генов CDKN2А и MITF-М, предрасполагающие к развитию меланомы по пути lowCSD. MITF повышает экспрессию CDKN2A. Мутации BRAFV600E поддерживают как снижение, так и повышение уровней транскрипции MITF, способствуя пролиферации и выживанию клеток меланомы. Все образцы mtBRAF ANM и mtBRAF NM обнаруживают меньшую корреляцию с наследованием и развиваются по пути lowCSD и highCSD. Три образца NM с наименьшей концентрацией ДНК и ЧК мутантной ДНК – wtBRAF, остальные – mtBRAF. Определены параметры протокола xMAP-ASPE-xTAG согласно общей площади образца и площади образования, общей и мутантной концентрации ДНК, оптимальной концентрации реагентов, количества микросфер.

Практическая значимость. Исследования проводятся в рамках разработки отечественной диагностической тест-системы с использованием технологии xMAP-ASPE-xTAG с целью ранней диагностики и выявления предрасположенности к развитию меланомы.

Антонова Е.И. ,Фирсова Н.В., Ачилов А.Б., Зимнуров А.Р., Балацюк Е.В. Молекулярно-генетический ландшафт узловой меланомы // Технологии живых систем. 2025. T. 22. № 4. С. 57-65. DOI: https://doi.org/10.18127/j20700997-202504-07

1. Garbe C., Amaral T., Peris K. et al. European consensus-based interdisciplinary guideline for melanoma. Part 1: Diagnostics: Update 2022 // Eur. J. Cancer. 2022. V. 170. P. 236–255.
2. Alshaghel M.M., Almahairi L., Arian R. et al. Amelanotic nodular melanoma misdiagnosed as a benign skin lesion: A rare case report from Syria // Annals of Medicine and Surgery. 2022. V. 74. P. 103316. DOI: 10.1016/j.amsu.2022.103316
3. Long G.V., Swetter S.M., Menzies A.M. et al. Cutaneous melanoma // Lancet. 2023. V. 402. P. 485–502.
4. Buzaid A.C., Gershenwald J.E. Tumor, node, metastasis (TNM) staging system and other prognostic factors in cutaneous melanoma // UpToDate. 2023. https://www.uptodate.com/contents/tumor-node-metastasis-tnm-staging-system-and-other-prognostic-factors-in-cutaneous-melanoma#H129747318
5. Mirek J., Bal W., Olbryt M. Melanoma genomics – will we go beyond BRAF in clinics? // J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2024. V. 150. P. 433. DOI: 10.1007/s00432-024-05957-2
6. Guźniczak A., Sosnowska-Sienkiewicz P., Szydłowski J. et al. Gene mutation-negative malignant melanoma in a prepubertal patient: a clinical and molecular case report // Genes. 2025. V. 16(8). P. 937. DOI: 10.3390/genes16080937
7. Druskovich C., Kelley J., Aubrey J. et al. A review of melanoma subtypes: genetic and treatment considerations // Journal of Surgical Oncology. 2025. V. 131. P. 356–364.
8. Newell F., Johansson P.A., Wilmott J.S. et al Comparative genomics provides etiologic and biological insight into Melanoma subtypes // Cancer Discov. 2022. V. 12. P. 2856–2879.
9. Gronbeck C., Kerr P.E. Nodular melanoma // Clinics in Dermatology. 2025. V. 43. Is. 1. P. 64–70.
10. Susok L., Stücker M., Bechara F.G. et al. Multivariate analysis of prognostic factors in patients with nodular melanoma // J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2021. V. 147(9). P. 2759–2764.
11. Wolchok J.D., Chiarion-Sileni V., Gonzalez R. et al Long-term outcomes with nivolumab plus ipilimumab or nivolumab alone versus ipilimumab in patients with advanced melanoma // J. Clin. Oncol. 2022. V. 40. P. 127–137.
12. Teixido C., Castillo P., Martinez-Vila C., et al. Molecular markers and targets in melanoma // Cells. 2021. V. 10(9). P. 2320. DOI: 10.3390/cells10092320
13. Bobos M. Histopathologic classification and prognostic factors of melanoma: a 2021 update // Ital. J. Dermatol. Venerol. 2021.
    V. 156. P. 300–321.
14. Ferrara G., Argenziano G. The WHO 2018 classification of cutaneous melanocytic neoplasms: suggestions from routine practice // Frontiers in Oncology. 2021. V. 11. Article 675296. DOI: 10.3389/fonc.2021.675296
15. Huang C., Lau T.W-S., Smoller B.R. Diagnosing cutaneous melanocytic tumors in the molecular era: updates and review of literature // Dermatopathology. 2024. V. 11(1). P. 26–51.
16. Rauwerdink D.J.W., van Doorn R., van der Hage J. et al. Systemic therapy in advanced nodular melanoma versus superficial spreading melanoma: a nation-wide study of the dutch melanoma treatment registry // Cancers. 2022. V. 14(22). P. 5694. DOI: 10.3390/cancers14225694
17. Jiang C., Jain N.P., Stewart C.L. Amelanotic melanoma: clinical presentation, diagnosis, and management // Clinics in Dermatology. 2025. V. 43. Is. 1. P. 10–15.
18. Ito T., Tanaka Y., Murata M. et al. BRAF geterogeneity in melanoma // Curr. Treat. Options in Oncol. 2021. V. 22. P. 20. DOI: 10.1007/s11864-021-00818-3
19. Colombino M., Casula M., Paliogiannis P. et al. Heterogeneous pathogenesis of melanoma: BRAF mutations and beyond // Crit. Rev. Oncol. Hematol. 2024. V. 201. P. 104435.
20. Zablocka T., Kreismane M., Pjanova D., Isajevs S. Effects of BRAF V600E and NRAS mutational status on the progressionfree survival and clinicopathological characteristics of patients with melanoma // Oncol. Lett. 2022. V. 25. P. 27. DOI: 10.3892/ol.2022.13613
21. Антонова Е.И., Ачилов А.Б., Фирсова Н.В. Разработка xMAP-протокола ASPE детекции мутаций генов BRAF и MITF в образцах поверхностно-распространяющейся меланомы кожи // Научный медицинский вестник Югры. 2024. Т. 42. № 4. С. 53–62.
22. Dilshat R., Fock V., Kenny C. et al. MITF reprograms the extracellular matrix and focal adhesion in melanoma // Cancer BiologyGenetics and Genomics. eLife. 2021. V. 10. P. e63093. DOI: 10.7554/eLife.63093
23. Gelmi M.C., Houtzagers L.E., Strub T. et al. MITF in normal melanocytes, cutaneous and uveal melanoma: a delicate balance // Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 6001. DOI: 10.3390/ ijms23116001
24. Vu H.N., Dilshat R., Fock V., Steingrímsson E. User guide to MiT-TFE isoforms and post-translational modifications // Pigment Cell Melanoma Res. 2021. V. 34. P. 13–27.
25. Wallingford C.K., Maas E.J., Howard A. et al. MITF E318K: A rare homozygous case with multiple primary melanoma // Pigment Cell Melanoma Res. 2024. V. 37. P. 68–73.
26. Снарская Е.С., Олисова О.Ю., Васильева К.Д. Амеланоцитарная узловая меланома кожи у пациентки с отягощённым семейным анамнезом // Российский журнал кожных и венерических болезней. 2022. Т. 25. № 4. C. 261–268.
27. Aebischer V., Abu-Ghazaleh A., Metzler G. et al. Histopathologic abundance of pigmentation correlates with disease-specific survival in malignant melanoma but is not independent of current AJCC pT stage // Pigment Cell Melanoma Res. 2023. V. 36. P. 512–521.
28. Cabaço L.C., Tomás A., Pojo M., Barral D.C. The dark side of melanin secretion in cutaneous melanoma aggressiveness // Frontiers in Oncology. 2022. V. 12. P. 887366. DOI: 10.3389/fonc.2022.887366
29. Антонова Е.И., Фирсова Н.В., Балацюк Е.В. ХМАР-технологии в области диагностики заболеваний и фундаментальных исследований // Технологии живых систем. 2025. Т. 22. № 1. С. 42–59.