А.А. Осипова1, Д.А. Рябчиков2, С.В. Чулкова3, А.М. Бурдённый4, В.И. Логинов5, Н.Е. Кушлинский6

1,6 ФГБОУ ВО «Российский университет медицины» (Москва, Россия)

2,3,6 ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина»
Минздрава России (Москва, Россия)

3 ФГAOУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. И.И. Пирогова» Минздрава России (Москва, Россия)

4,5 ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии» (Москва, Россия)

5 ФГБНУ Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова, (Москва, Россия)

1 osipova_ronc@mail.ru

Постановка проблемы. днРНК – транскрипты, которые играют регуляторную роль во многих биологических процессах,
а их экспрессионный профиль связан с пролиферацией, миграцией, инвазией клеток. Метилирование генов днРНК может приводить к нарушению их функций.

Цель работы – изучение статуса метилирования генов днРНК MEG3, SEMA3B-AS1 при люминальном раке молочной железы (РМЖ) и оценка их клинической значимости.

Результаты. В исследование включены 367 больных РМЖ. Преобладала Т1 – 142 (38,7%) и Т2 – 204 (55,6%) стадии, N0 и N1 статус соответственно 198 (54,0%) и 139 (37,9%). Люминальный А выявлен в 28,6%, В Her2neu«-» – в 30,3%, В Her2neu«+» – в 27,2%, в 6,3% установлен Erb-B2 – сверхэкспрессирующий подтип и в 7,6% – трижды-негативный подтип. В 77,1% случаев – инвазивный протоковый, в 12,8% – дольковый, преимущественно G2 – 62,9%. Изучили метилирование СpG-районов промоторных областей генов днРНК MEG3, SEMA3B-AS1 в парных образах опухолевой и гистологически неизмененной ткани молочных желез методом метилспецифичной полимеразной цепной реакции (МС-ПЦР). Амплификатор T100 (“Bio-Rad”, США). Праймеры подобраны с помощью пакета программ Lasergene 17.1 компании DNASTAR (США). Статистическую обработку данных проводили в программе SPSS, v. 23. Выявили, что частота метилирования генов MEG3, SEMA3B-AS1 в ткани опухоли достоверно выше, чем в гистологически неизмененной ткани. Метилирование исследованных генов связано с возрастом (R= –0,24 – для MEG3 и R = –0,36 – для SEMA3B-AS1) и возрастает при увеличении стадии опухолевого процесса. Установлена корреляционная связь метилирования генов MEG3, SEMA3B-AS1 со стадией опухоли (R = 0,46 и R = 0,33 соответственно, р < 0,05), индексом T (R = 0,43 и R = 0,36 соответственно, р < 0,05). При увеличении стадии опухоли (I–II–III) частота метилирования генов нарастает. В ткани опухоли MEG3 и SEMA3B-AS1 кометилированы (R = 0,79, р < 0,05). Метилирование MEG3, SEMA3B-AS1 связано со снижением показателей 5-, 10-летней общей выживаемости (ОВ) и временем без прогрессирования (ВБП) при люминальном РМЖ железы I-II стадий.

Практическая значимость. При РМЖ в ткани опухоли частота метилирования генов днРНК MEG3, SEMA3B-AS1 превышает таковую в гистологически неизмененной ткани, что подтверждает супрессорную активность этих генов. Взаимосвязь стадии, размера первичной опухоли, ОВ, ВБП с высокой частотой метилирования в ткани опухоли генов MEG3, SEMA3B-AS1 позволяет рассматривать их в качестве прогностических маркеров.

Осипова А.А., Рябчиков Д.А., Чулкова С.В., Бурдённый А.М., Логинов В.И., Кушлинский Н.Е. Клиническое значение метилирования генов днРНК MEG3, SEMA3B-AS1 в опухоли больных люминальным раком молочной железы // Технологии живых систем. 2024. T. 21. № 3. С. 74-83. DOI: https://doi.org/10.18127/j20700997-202403-08

1. Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I. et al. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries // CA Cancer J. Clin. 2018. V. 68. № 6. P. 394–424.
2. Sung H., Ferlay J., Siegel R.L. et al. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries // CA Cancer J. Clin. 2021. V. 71. № 3. P. 209–249.
3. Esteva F.J., Hubbard-Lucey V.M., Tang J. et al. Immunotherapy and targeted therapy combinations in metastatic breast cancer // Lancet Oncol. 2019. V. 20. № 3. P. e175–e186.
4. Liu B., Fan Y., Song Z. et al. Identification of DRP1 as a prognostic factor correlated with immune infiltration in breast cancer // Int. Immunopharmacol. 2020. V. 89(Pt B). P. 107078.
5. Рябчиков Д.А., Абдуллаева Э.И., Дудина И.А. и др. Роль микро-РНК в канцерогенезе и прогнозе злокачественных новообразований молочной железы // Вестник Российского научного центра рентгенорадиологии. 2018. Т. 18. № 2. С. 5.
6. Sinn B.V., Weber K.E., Schmitt W.D. et al. Human leucocyte antigen class I in hormone receptor-positive, HER2-negative breast cancer: association with response and survival after neoadjuvant chemotherapy // Breast Cancer Res. 2019. V. 21. № 1. P. 142.
7. Рябчиков Д.А., Безнос О.А., Дудина И.А. и др. Диссеминированные опухолевые клетки у пациентов с люминальным раком молочной железы // Российский биотерапевтический журнал. 2018. Т. 17. № 1. С. 53–57.
8. Титов К.С., Казаков А.М., Барышникова М.А. и др. Некоторые молекулярные и иммунологические факторы прогноза трижды негативного рака молочной железы // Онкогинекология. 2019. Т. 32. № 4. С. 26–34.
9. Талипов О.А., Рябчиков Д.А., Чулкова С.В. и др. Метилирование генов супрессорных микроРНК при раке молочной железы // Онкогинекология. 2020. Т. 34. № 2. С. 14–22.
10. Логинов В.И., Терешкина И.В., Кушлинский Д.Н. и др. Анализ уровней метилирования генов микроРНК в опухоли и метастазах с учетом концентраций VEGF в плазме крови больных раком яичников // Технологии живых систем. 2023. Т. 1. № 1. С. 5–15.
11. Wang S., Yang L., Lin Ch. et al. JAK2-binding long noncoding RNA promotes breast cancer brain metastasis // J. Clin. Invest. 2017. V. 127. № 12. С. 4498–4515.
12. Arun G., Diermeier S., Akerman M. et al. Differentiation of mammary tumors and reduction in metastasis upon Malat1 lncRNA loss // Genes Dev. 2016. V. 30. № 1. P. 34–51.
13. Luo N., Zhang K., Li X., Hu Y. ZEB1 induced-upregulation of long noncoding RNA ZEB1-AS1 facilitates the progression of triple negative breast cancer by binding with ELAVL1 to maintain the stability of ZEB1 mRNA // J. Cell Biochem. 2020. V. 121. № 10. P. 4176–4187.
14. Филиппова Е.А., Пронина И.В., Лукина С.С., Логинов В.И., Казубская Т.П., Брага Э.А. Идентификация аберрантно экспрессируемых длинных некодирующих РНК в тканях рака молочной железы: экспериментальное исследование // Успехи молекулярной онкологии. 2022. Т. 9. № 4. Приложение. С. 25.
15. Li T., Xie J., Shen C. et al. Upregulation of long noncoding RNA ZEB1-AS1 promotes tumor metastasis and predicts poor prognosis in hepatocellular carcinoma // Oncogene. 2016. V. 35. № 12. P. 1575–1584.
16. Zhao Y., Wang N., Zhang X. et al. LncRNA ZEB1-AS1 down-regulation suppresses the proliferation and invasion by inhibiting ZEB1 expression in oesophageal squamous cell carcinoma // J. Cell Mol. Med. 2019. V. 23. № 12. P. 8206–8218.
17. Zhang J.J., Guo S.H., Jia B.Q. Down-regulation of long noncoding RNA MEG3 serves as an unfavorable risk factor for survival of patients with breast cancer // Eur. Rev. Med. Pharmacol. Sci. 2016. V. 20. № 24. P. 5143–5147.
18. Филиппова Е.А., Логинов В.И., Лукина С.С., Бурдённый А.М., Пронина И.В., Казубская Т.П., Брага Э.А. Группа новых гиперметилируемых генов длинных некодирующих РНК, как фактора развития и прогрессии рака молочной железы // Патологическая физиология и экспериментальная терапия. 2021. Т. 65. № 3. С. 4–11.