350 руб
Журнал «Технологии живых систем» №9 за 2013 г.
Статья в номере:
Влияние CA-микросателлитов на гомологичную рекомбинацию
Ключевые слова: микросателлиты (CA/TG)n-повторы гомологичная рекомбинация структура Холлидея
Авторы:
Н.Ю. Карпеченко - мл. науч. сотрудник, отдел химического канцерогенеза, ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н. Блохина» РАМН. E-mail: nojadg@mail.ru В.К. Гасанова - к.м.н., ст. науч. сотрудник, отдел химического канцерогенеза, ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н.Блохина» РАМН. E-mail: victoriag@inbox.ru В.И. Попенко - д.б.н., вед. науч. сотрудник, лаборатория биологии клетки, ФГБУ Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН. E-mail: popenko@eimb.ru М.Г. Якубовская - д.м.н., руководитель отдела химического канцерогенеза, ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н. Блохина» РАМН. E-mail: mgyakubovskaya@mail.ru
Аннотация:
С помощью электронной микроскопии популяций структур Холлидея, образованных фрагментами ДНК, содержащими (СА/TG)n-повторы или рендомные последовательности эквивалентного размера, продемонстри¬ровано торможение точки ветвления структур Холлидея в районе повторяющихся последовательностей при условии наличия в них гетерологии по количеству повторяющихся единиц.
Страницы: 33-39
Список источников

 

  1. Moynahan M.E., Jasin M. Mitotic homologous recombination maintains genomic stability and suppresses tumorigenesis // Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2010. V. 11. № 3. P. 196-207.
  2. Глазер В.М. Гомологичная генетическая рекомбинация // Соросовский образовательный журнал. 1998. № 7. С. 13-21.
  3. San Filippo J., Sung P., Klein H. Mechanism of eukaryotic homologous recombination // Ann. Rev. Biochem. 2008. V. 77. P. 229-257.
  4. Heyer W.D., Ehmsen K.T., Liu J. Regulation of homologous recombination in eukaryotes // Ann. Rev Genet. 2010. V. 44. P. 113-139.
  5. Bennett P. Demystified ... microsatellites // Mol. Pathol. 2000. V. 53. № 4. P. 177-183.
  6. Никитина Т.В., Назаренко С.А. Микросателлитные последовательности ДНК человека: мутационный процесс и эволюция // Генетика. 2004. Т. 4. № 10. С. 1301-1318.
  7. Majewski J., Ott J. GT repeats are associated with recombination on human chromosome 22 // Genome Res. 2000. V. 10. № 8. P. 1108-1114.
  8. Yakubovskaya M.G., Neschastnova A.A., Humphrey K.E. et al. Interaction of linear homologous DNA duplexes via Holliday junction formation // Eur. J. Biochem. 2001. V. 268. № 1. P. 7-14.
  9. Gendrel C.G., Boulet A., Dutreix M. (CA/GT)(n) microsatellites affect homologous recombination during yeast meiosis // Genes Dev. 2000. V. 14. № 10. P. 1261-1268.
  10. Hui J.,Hung L.H.,Heiner M.,Schreiner S.,Neumüller N.,Reither G.,Haas S.A.,Bindereif A. Intronic CA-repeat and CA-rich elements: new class of regulators of mammalian alternative splicing // EMBO J. 2005. V. 24. № 11. P. 1988-1998.
  11. Treco D., Arnheim N. The evolutionarily conserved repetitive sequence d(TG.AC)n promotes reciprocal exchange and generates unusual recombinant tetrads during yeast meiosis // Mol. Cell. Biol. 1986. V. 6. № 11. P. 3934-3947.
  12. Sawaya S., Bagshaw A., Buschiazzo E. et. al.Microsatellite tandem repeats are abundant in human promoters and are associated with regulatory elements // PLoS One. 2013. V. 8. № 2.
  13. Huang Q.Y., Xu F.H., Shen H. et. al. Mutation patterns at dinucleotide microsatellite loci in humans // Am. J. Hum. Genet. 2002. V. 70. № 3. P. 625-634.
  14. Thomas T.J., Messner R.P. A left-handed (Z) conformation of poly(dA-dC).poly(dG-dT) induced by polyamines // Nucleic Acids Res. 1986. V. 14. № 16. P. 6721-6733.
  15. Kaluzhny D., Shchyolkina A., Livshits M. et. al.A novel intramolecular G-quartet-containing fold of single-stranded d(GT)(8) and d(GT)(16) oligonucleotides // Biophys Chem. 2009. V. 143. № 3. P. 161-165.
  16. Benet A., Azorín F. The formation of triple-stranded DNA prevents spon­taneous branch-migration // J. Mol. Biol. 1999. V. 294. № 4. P. 851-857.
  17. Zimmer C., Tymen S., Marck C., Guschlbauer W. Conformational transitions of poly(dA-dC). poly(dG-dT) induced by high salt or in ethanolic solution // Nucleic Acids Res. 1982. V. 10. № 3. P. 1081-1091.
  18. Bzymek M., Lovett S.T. Instability of repetitive DNA sequences: the role of replication in multiple mechanisms // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001. V. 98. № 15. P. 8319-8325.
  19. Panyutin I.G., Hsieh P. Formation of a single base mismatch impedes spontaneous DNA branch migration // J. Mol. Biol. 1993. V. 230. № 2. P. 413-424.
  20. Levinson G., Gutman G.A. High frequencies of short frameshifts in poly-CA/TG tandem repeats borne by bacteriophage M13 in Escherichia coli K-12 // Nucleic Acids Res. 1987. V. 15. № 13. P. 5323-5338.
  21. Shinde D., Lai Y., Sun F., Arnheim N. Taq DNA polymerase slippage mutation rates measured by PCR and quasi-likelihood analysis: (CA/GT)n and (A/T)n microsatellites // Nucleic Acids Res. 2003. V. 31. № 3. P. 974-980.