350 руб
Журнал «Биомедицинская радиоэлектроника» №1 за 2012 г.
Статья в номере:
Анализ первичной структуры белковых токсинов болезнетворных водных бактерий
Ключевые слова: патогенные бактерии токсины множественное выравнивание интервальные статистики
Авторы:
Екатерина Олеговна Михайлова - к.б.н., ассистент, кафедра химической кибирнетики, ГОУ ВПО «Казанский национальный исследовательский технологический университет» Айрат Рашитович Каюмов - к.б.н., ст. преподаватель, кафедра водоснабжения и водоотведения, ФГОУ ВПО «Казанский государственный архитектурно-строительный университет». E-mail: kairatr@yandex.ru Олег Александрович Маркелов - аспирант, кафедра радиотехнических систем, ГОУ ВПО «Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина). E-mail: omarkelov@yandex.ru Алсу Абриковна Хамидуллина - ст. преподаватель, кафедра водоснабжения и водоотведения, ФГОУ ВПО «Казанский государственный архитектурно-строительный университет». E-mail: alsu-13@list.ru Лилия Рахимзяновна Хисамеева - доцент, кафедра водоснабжения и водоотведения, ФГОУ ВПО «Казанский государственный архитектурно-строительный университет». E-mail: khisameeva_liliya@mail.ru Михаил Игоревич Богачев - к.т.н., докторант, кафедра радиотехнических систем, ГОУ ВПО «Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина). E-mail: rogex@mail333.com
Аннотация:
Проведен статистический анализ полипептидных последовательностей токсинов патогенных бактерий, определяющих эпидемическую опасность водоемов. Методами множественного выравнивания идентифицированы участки гомологии в разных функциональных группах токсинов. Данные олигопептидные участки могут являться функциональными доменами, определяющими биологический эффект молекулы, и, вероятно, могут рассматриваться как мишени для новых средств детоксикации.
Страницы: 37-39
Список источников
  1. Бухарин О.В., Литвин В.Ю. Патогенные бактерии в природных экосистемах. Екатеринбург. 1997.
  2. Finlay B.B., Falkow S. Common themes in microbial pathogenicity revisited // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1997. V.61. P. 136-169.
  3. СупотницкийМ.В.Микроорганизмы, токсиныиэпидемии. М. 2000. 376 с.
  4. Schmitt C.K., Meysick K. C., O'Brien A.D. Bacterial Toxins: Friends or Foes - // Emerging Infectious Diseases. 1999. V.5. P.224 - 234.
  5. Finlay B.B., Falkow S.  Common themes in microbial pathogenicity // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1997. V.61. P.136 - 169.
  6. Богачев М.И., Каюмов А.Р., Маркелов О.А. Алгоритм предварительного отбора белковых последовательностей для множественного выравнивания в условиях априорной неопределенности на основе теории графов // Биотехносфера. 2011. №3.
  7. Богачев М.И., Каюмов А.Р., Михайлова Е.О.  Анализ структуры сигналов и функциональной организации биокаталитических систем с использованием математического аппарата интервальных статистик // Известия вузов России. Сер. Радиоэлектроника. 2010. № 3. С. 8 - 16.
  8. Богачев М.И., Каюмов А.Р. Сравнительный анализ первичной структуры белков патогенных и непатогенных микроорганизмов при помощи математического аппарата интервальных статистик // Биомедицинские технологии и радиоэлектроника. 2010. № 11. С. 3 - 11.
  9. Bogachev M.I., Kireenkov I.S., Nifontov E.M., Bunde A. Statistics of return intervals between long heartbeat intervals and their usability for online prediction of disorders // New Journal of Physics. 2009. V.11. P.063036(1 - 18).
  10. Zientz E., Dandekar T., Gross R. Metabolic interdependence of obligate intracellular Bacteria and their insect hosts // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004. V. 68. P.745 - 770.
  11. Fabbri A. et al. Bacterial protein toxins: current and potential clinical use // Curr. Med. Chem. 2008. V. 15. P. 1116 - 1125.