350 руб
Журнал «Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии» №10 за 2014 г.
Статья в номере:
Полифункциональность пирувата
Ключевые слова: малые молекулы пируват молекулярное модулирование биологическая активность
Авторы:
Е.А. Рыскина - к.б.н., доцент, кафедра биохимии имени академика Т.Т. Березова, Российский университет дружбы народов (Москва). E-mail: dar31@mail.ru
Аннотация:
Представлены результаты биологических эффектов малой молекулы пирувата с помощью «компьютерной программы «Prediction of Activity Spectra for Substances» (PASS). Показана вероятность наличия 257 фармакологических эффектов из 384 вероятных и 1578 механизмов их реализации из 2242. Найдено 35 из 41 вероятных побочных и токсических эффектов, 56 метаболически опосредованных действий.
Страницы: 42-46
Список источников

  1. Jordan K.W., Nordenstam J., Lauwers G.Y., Rothenberger D.A., Alavi K., Garwood M., Cheng L.L. Metabolomic characterization of human rectal adenocarcinoma with intact tissue magnetic resonance spectroscopy // Diseases of the Colon & Rectum. 2009. V. 52 (3). P. 520-525.
  2. Oliver S.G., Winson M.K., Kell D.B., Baganz F. Systematic functional analysis of the yeast genome // Trends in Biotechnology. 1998. V. 16 (9). P. 373-378.
  3. Griffin J.L., Vidal-Puig A. Current challenges in metabolomics for diabetes research: a vital functional genomic tool or just a ploy for gaining funding - // Physiol. Genomics. 2008. V. 34 (1). P. 1-5.
  4. Samuelsson L.M., Larsson D.G. Contributions from metabolomics to fish research // Mol. Biosyst. 2008. V. 4 (10). P. 974-979.
  5. Wishart D.S., Tzur D., Knox C. et al. HMDB: the Human Metabolome Database // Nucleic Acids Research. 2007. V. 35 (Databaseissue). P. 521-526.
  6. Малыгин А.Г. Структурно-химический подход к организации материала на метаболических картах // Биохимия. 2004. Т. 69. Вып. 12. С. 1691-1699.
  7. Wishart D.S., Jewison T., Guo A.C., Wilson M., Knox C., et al. HMDB 3.0. The Human Metabolome Database in 2013. Nucleic Acids Res. 2013. V. 41 (Database issue). P. 801-807.
  8. Sharma S., Moon C.S., Khogali A., Haidous A., Chabenne A., Ojo C., Jelebinkov M., Kurdi Y., Ebadi M. Biomarkers in Parkinson-s disease (recent update) // Neurochem. Int. 2013. V. 63. P. 201-229.
  9. Гильмиярова Ф.Н., Радомская В.М., Рыскина Е.А. и др. Минорные компоненты метаболизма в регуляции белок-белковых взаимодействий // Медицинский альманах. 2013. №2 (26). С. 184.
  10. Гильмиярова Ф.Н., Радомская В.М., Гусякова О.А. и др. Влияние малых молекул на процессы межмолекулярного взаимодействия, лежащие в основе лигандных технологий лабораторной диагностики // Клиническая лабораторная диагностика. 2010. № 7. С. 14 - 18.
  11. Cody G.D., Boctor N.Z., Filley T.R., Hazen R.M., Scott J.H., Sharma A., Yoder H.S. Primordial carbonylated iron-sulfur compounds and the synthesis of pyruvate // Science. 2000. V. 289 (5483). P. 1337-1340.
  12. Бойко, Т.К. Содержание метаболитов и активность ферментов в участках сопряжения углеводного и липидного обменов при атеросклерозе // Автореф. дис. канд. мед. наук. Куйбышев. 1983. С. 45-50.
  13. Грибов Л.А., Баранов В.И. Теория и методы расчета молекулярных процессов: спектры, химические превращения и молекулярная логика. 2006. С. 480.
  14. Sadek H., Hannack B., Choe Е. et al. Cardiogenic small molecules that enhance myocardial repair by stem cell // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. V. 105. № 16. P. 6063-6068.
  15. Lipchock, J.M., J.P.Loria. Monitoring molecular interactions by NMR // Methods. Mol.Biol. 2009. V. 490. P. 115-134.
  16. Хельтье Х.Д., Зиппль В., Роньян Д., Фолькерс Г. Молекулярное моделирование. М. 2010. С. 12-16.
  17. Филимонов Д.А., Поройков В.В. Прогноз спектра биологической активности органических соединений // Российский химический журнал. 2006. № 2. C. 66-75.
  18. Dinarello C.A. Inflamantory cytokines: interleukin-1 and tumor necrosis factor as effector molecules in autoimmune disease // Cur. Opin. Immunol. 1991. V. 3. P. 941-948.
  19. Troyanovsky S.M. Mechanism of cell-cell adhesion complex assembly // Curr. Opin. Cell Biol. 1999. V. 11. P. 561-566.
  20. Curley G.P., Blum H., Humphries M.J. Integrin antagonists // Cell. Mol. Life Sci. 1999. V. 56. P. 427 - 441.
  21. Logan A. Intracrine regulation at the nucleus - a further mechanism growth factor activity - // J. Endocr. 1990. V. 125. P. 339 - 343.
  22. Пальцев, М.А., Иванов А.А. Межклеточные взаимодействия. М.: Медицина. 1995.
  23. Пальцев, М.А., Иванов А.А., Северин С.Е. Межклеточные взаимодействия. М.:Медицина. 2003. С. 288.
  24. Sporn M.B. The importance of context in cytokine action // Kidney Int. 1997. V. 51. P. 1352 - 1354.
  25. Исляйкин М.К., Данилова Е.А., Кудрик Е.В. и др. Макрогетероциклические соединения и их металлокомплексы. Синтез и исследование противоопухолевой активности // Химико-фармацевтический журнал. 1997. Т. 31. №8. С. 19-22.
  26. Di Giorgioa С., Delmasa F., Ollivierb Е., Eliasb R., Balansardb, G., Timon-Davida P. In vitro activity of the β-carboline alkaloids harmane, harmine, and harmaline toward parasites of the species Leishmania infantum // Experimental Parasitology V. 106. 2004. P. 67-74.
  27. Коновалов Ю.Б. Фармакогностическое изучение полыни австрийской как источника фармакологически активных сесквитерпеновых лактонов // Автореф. дис. канд. фарм. наук. Пятигорск. 2007.
  28. Флехтер О.Б., Карачурина Л.Т., Поройков В.В. и др. Синтез эфиров тритерпеноидов группы лупана и их гепатопротекторная активность // Биоорганическая химия. 2000. Т. 26. №3. С. 215-223.
  29. Поройков В.В., Филимонов Д.А., Глориозова Т.А., Лагунин А.А., Дружиловский Д.С., Степанчикова А.В. Компьютерное предсказание биологической активности химических веществ: виртуальная хемогеномика // Информационный вестник ВОГиС. 2009. 13 (1). C. 137-143.