350 руб
Журнал «Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии» №3 за 2013 г.
Статья в номере:
Новая математическая модель для прогнозирования эндотелиопротекторной активности веществ на основе молекулярного докинга
Ключевые слова: молекулярный докинг эндотелий оксид азота протеинкиназа изохинолин нафтиридин
Авторы:
А.В. Воронков - д.м.н., кафедра фармакологии и патологии, Пятигорский медико-фармацевтический институт - филиал ГБОУ ВПО ВолгГМУ Минздрава России. E-mail: prohor.77@mail.ru А.А. Глушко - к.фарм.н., кафедра физической и коллоидной химии, Пятигорский медико-фармацевтический институт - филиал ГБОУ ВПО ВолгГМУ Минздрава России. E-mail:saha-omega@yandex.ru
Аннотация:
На основе данных о структуре и биологической активности 21 производного изохинолина и нафтиридина проведен молекулярный докинг с каталитическим центром протеинкиназы C-η. Для оценки связывания лиганда с рецептором использованы скоринговые функции. В результате анализа данных о связывании исследуемых соединений с ферментом получена математическая модель, позволяющая предсказывать значения pIC50 для ингибирования протеинкиназы C-η.
Страницы: 42-47
Список источников
  1. Maurice J. van Eis. et al. 2,6-Naphthyridines as potent and selective inhibitors of the novel protein kinase C isozymes // Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 2011. № 21. P. 7367 - 7372.
  2. Catterall W.A. Structure and function of voltage-sensitive ion channel // Science. 1988. № 242. P. 50 - 60.
  3. Chen P.F. et al. Mutationof Glu-361 inhuman endothelial nitric-oxide synthase selectively abolishes L-arginine binding without perturbing the behavior of heme and other redox centers // J. Biol. Chem.1997. № 272. P. 6114 - 6118.
  4. Freeley M., Kelleher D., Long A. Regulation of protein kinase C function by phosphorylation on conserved and non-conserved sites // Cell Signal. 2011. № 23. P. 753 - 762.
  5. Fleming I., Busse R. Signal transduction of eNOS activation // Cardiovascular Research. 1999. № 43. P. 532 - 541.
  6. Iwai N., Inagami T. Identification of two subtypes in the rat type I angiotensin II receptor // FEBS Lett. 1992. № 24. P. 257-260.
  7. Jansen-Olesen I. Role of endothelium and nitric oxide in histamine-induced responses in human cranial arteries and detection of mRNA encoding H1- and H2-receptors by RT-PCR // Br. J. Pharmacol.1997. № 121(1). P. 41 - 48.
  8. Iwabayashi M. Role of serotonin in angiogenesis: Induction of angiogenesis by sarpogrelate via endothelial 5-HT1B/Akt/ eNOS pathway in diabetic mice // Atherosclerosis. 2012. № 220. P. 337 - 342.
  9. Michell B.J. Coordinated control of endothelial nitric-oxide synthase phosphorylation by protein kinase C and the cAMP-dependent protein kinase // J. Biol. Chem. 2001. № 276. P. 17625 - 17628.
  10. Morris G. M.Automated Docking Using a Lamarckian Genetic Algorithm and and Empirical Binding Free Energy Function // J. Computational Chemistry.1998. №19. P. 1639 - 1662.
  11. Wagner J. Discovery of 3-(1H-indol-3-yl)-4-[2-(4-methy­lpiperazin-1-yl)quinazolin-4-yl]pyrrole-2,5-dione (AEB071), a potent and selective inhibitor of protein kinase C isotypes // J. Med. Chem. 2009. № 52. P.6193 - 6196.